Os objectivos da unidade curricular de Reprodução Animal, são proporcionar aos estudantes informação sobre as características reprodutivas e maneio reprodutivo bem como as técnicas e métodos naturais e farmacológicos de controlo e de manipulação da reprodução das espécies consideradas de interesse zootécnico e dos animais de companhia. Além disso, pretende preparar convenientemente os estudantes para efectuarem planos de maneio e controlo reprodutivo em explorações de animais, numa perspectiva economicista, sem esquecer, nunca, o bem-estar e o respeito pelos direitos dos animais.

Tendo em conta as saídas profissionais do curso de mestrado em Engenharia Zootécnica, esta unidade curricular pretende ainda assegurar a formação necessária para desenvolvimento de investigação fundamental e aplicada nas diferentes áreas associadas à Reprodução Animal.